É só permitir pagamentos com apps abertos nas configurações do seu celular.

Assim você mantém o app que você já usa (app padrão) e quando for pagar com Mercado Pago, basta abrir o aplicativo antes de aproximar da maquininha.

Como fazer em Samsung, Motorola e Xiaomi:

Celulares Samsung

1. Primeiro acesse as Configurações;
2. Depois entre em Conexões;
3. Vá em NFC;
4. Escolha Pagamentos sem contato ou Pagar com um toque;
5. Por último, ative a opção pagar com app aberto e pronto.

Celulares Motorola

1. Primeiro acesse Configurações;
2. Depois entre em Apps e notificações;
3. Vá em Apps padrões;
4. Escolha Toque e pague;
5. Por último, em Usar padrão, escolha a opção de quando não há app de pagamento aberto e pronto.

Celulares Xiaomi

1. Primeiro acesse Configurações;
2. Depois entre em Mais;
3. Vá em Toque e pague
4. Por último, em Usar padrão, escolha a opção de substituir app padrão quando outro app estiver aberto e pronto.

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Mesmo sendo de outra marca, a maioria dos celulares Android têm passos parecidos. É só buscar nas configurações como habilitar mais de um app.

Tudo pronto para pagar por aproximação